Ο Κάρλος Ζέκα ξεκίνησε στο βασικό σχήμα στον αγώνα του Παναθηναϊκού εναντίον του Πανσερραϊκού και έφτασε τις 200 συμμετοχές σε παιχνίδια πρωταθλήματος.

Μετά από έξι πολύ παραγωγικές σεζόν με τους “πράσινους” έφυγε το καλοκαίρι του 2017 για την Κοπεγχάγη, αφού πρώτα αγωνίστηκε σε δύο αναμετρήσεις για το πρωτάθλημα και έφτασε τα 190 ματς στη διοργάνωση. Αυτό το καλοκαίρι επέστρεψε στην Ελλάδα και τον Παναθηναϊκό και με τις 10 συμμετοχές του συμπλήρωσε τα 200 παιχνίδια πρωταθλήματος.

Γίνεται μόλις ο 25ος μέσος στην ιστορία της ομάδας που φτάνει αυτό τον αριθμό για την Super League, ενώ πέρασε τον Άγγελο Μπασινά και τον Ανδρέα Παπαεμμανουήλ που είχαν σταματήσει στις 199 παρουσίες.

Συνολικά ο Ζέκα έχει αγωνιστεί σε 261 αναμετρήσεις με τον Παναθηναϊκό σε όλες τις διοργανώσεις, αφού έχει 24 ματς χωρίς γκολ στο Κύπελλο Ελλάδος και 37 ματς με ένα γκολ στις ευρωπαϊκές του παρουσίες. Η πιο παραγωγική του σεζόν ήταν το 2014-15 με 44 ματς και δύο γκολ σε όλες τις διοργανώσεις.