Με τη διεξαγωγή αγώνων της 3ης φάσης, στην οποία συμμετέχουν και οι ομάδες της Super League 2, συνεχίζεται την Τετάρτη 13 Σεπτεμβρίου το Κύπελλο Ελλάδας.
Όπως προέκυψε από την κλήρωση, στην φάση αυτή της διοργάνωσης έχουν προκριθεί άνευ αγώνα, ο Διαγόρας, ο Μικρασιατικός, ο Πιερικός, ο Αλμωπός Αριδαίας, η Καλαμάτα και η ΑΕΛ. Οι αγώνες της 3ης φάσης θα είναι μονοί, στην έδρα των ομάδων που κληρώθηκαν πρώτες, ενώ σε περίπτωση ισοπαλίας θα ακολουθήσει η διαδικασία της παράτασης και -αν χρειαστεί- των πέναλτι. Αναλυτικά το πρόγραμμα της 3ης φάσης:
ΤΕΤΑΡΤΗ 13/9
15:00 Πανθρακικός-Εθνικός
16:00 Ζάκυνθος-Νίκη Βόλου
16:00 Μακεδονικός-Αιγάλεω
16:00 Ηλιούπολη-Λεβαδειακός
16:00 ΑΟ Χανιώτης-Τηλυκράτης
16:00 Ιωνικός-Καλλιθέα
16:00 Απόλλων Παραλιμνίου-Αλεξανδρούπολη
16:00 Κοζάνη-Ηρακλής
16:00 Αστέρας Σταυρού-Γιούχτας
16:00 Παναργειακός-ΠΑΟ Βάρδας
16:00 Αχαρναϊκός-Παναχαϊκή
ΚΥΡΙΑΚΗ 17/9
16:00 Κισσαμικός-Απόλλων Πόντου
16:00 Αιολικός-Αναγέννηση Καρδίτσας
- ΟΦ Ιεράπετρας-Καμπανιακός Ματαιώθηκε